El laboratorio de Bioinformática y Expresión Génica del Instituto de Nutrición y Tecnología de los Alimentos (INTA), Universidad de Chile busca Ingeniero bioinformático o profesional con conocimientos bioinformáticos, para proyectos de investigación de comunidades de microorganismos que habitan ambientes extremos.
Entre las competencias que se requieren, el postulante debe ser capaz de:
- Diseñar, desarrollar y operar flujos de análisis para datos de metagenómica, metatranscriptómica y análisis de microbiomas, a partir de secuencias tipo NGS (plataformas Illumina y Nanopore),
- Diseñar, desarrollar y operar flujos de análisis para la anotación funcional de genomas secuenciados, reconstruidos y metagenomas.
- Generar reportes internos relacionadas con el análisis de datos e idealmente desarrollar interfaces de visualización de resultados.
Es recomendable además que el candidato presente habilidades y experiencia en:
- Programación de lenguajes compilados y/o lenguajes de scripts (Perl, Python, R, JavaScript, etc.).
- Manipulación de grandes conjuntos de datos de NGS: transformación de datos, recorte de lectura, alineación, llamada de variantes entre otras.
- Dominio demostrable en sistemas operativos Unix/Linux.
- Capacidad y conocimiento de software como STAR, Metaphlan, SPADES, Eggnog, Prokka, entre otros.
- Estadística multivariada para análisis de secuencias 16S.
- Capacidad demostrada para comunicarse de manera eficiente y trabajar eficazmente con un equipo de científicos multidisciplinarios.
Interesados enviar CV incluyendo pretensiones de sueldo y al menos dos contactos de referencia
Plazo máximo de postulación: 30 de junio de 2022
Contacto: Dr. Christian Hodar (chodar@inta.uchile.cl)
Tipo de contrato: Honorarios
Fecha de publicación: 07 junio 2022
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