Científico Bioinformático para compañía Andes

Andes ayuda a los agricultores a mejorar los rendimientos de sus cultivos mediante el diseño y desarrollo de semillas con capacidades genéticas mejoradas mediante el uso de tecnología microbiana e inteligencia artificial.

Responsabilidades del cargo

Como miembro del equipo de Andes, el científico bioinformático se centrará en la bioinformática general y necesidades biológicas computacionales de la empresa, interactuando tanto con I&D como con las operaciones agrícolas.

Específicamente, su trabajo contribuirá al análisis de datos genéticos masivos de bacterias y plantas y empleará estos perfiles para generar conjuntos de datos estandarizados. Este trabajo es crucial para el desarrollo rápido y oportuno de productos benéficos para el sector agrícola. Se espera además que apoye a los directores técnicos y científicos para que contribuyan con el diseño experimental y promueva la discusión científica de los resultados.

Competencias

• Trabajar en colaboración con personal científico y el Ingeniero Data Scientist para construir, probar, adaptar, apoyar y validar rutas de ensamblaje de genomas.
• Creación de perfiles de datos NGS (Illumina/ThermoFisher) y modelado de datos sintéticos
• Crear conjuntos de datos de NGS estandarizados que se utilizarán para diseñar inoculantes beneficiosos para plantas y bacterias.
• Apoyo a I+D y operaciones agrícolas con la generación de bases de datos y resolución de problemas en materia de estudio.
• Comunicación fluida con el equipo multidisciplinario de Andes y generar reportes directos y periódicos al Director Científico.

Requisitos

Para calificar, el candidato ideal tendrá las siguientes habilidades y experiencia:

• Capacidad demostrada en el desarrollo de algoritmos para el análisis de grandes conjuntos de datos NGS y manipulación de grandes volúmenes de datos.
• Familiaridad con ensayos y técnicas de secuenciación (es decir, RNA-seq), y tecnologías de secuenciación de compañías como Illumina, ThermoFisher.
• Capacidad demostrada en la programación de lenguajes compilados y/o lenguajes de scripts (Perl, Python, R, JavaScript, etc.).
• Capacidad demostrada en la manipulación de grandes conjuntos de datos de NGS: transformación de datos, recorte de lectura, alineación, llamada de variantes y migración del almacén de datos.
• Dominio demostrable en sistemas operativos Unix/Linux.
• Capacidad demostrada para comunicarse de manera eficiente y trabajar eficazmente con un equipo de científicos multidisciplinarios.
• Al menos 2 años de experiencia en Bioinformática, Genómica, Genética, Ciencias de la Computación o un campo relacionado, o M.S. y/o Doctorado. Con más de 4 años de experiencia, o equivalente.

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