Escuela de Verano – 24 al 28 de enero, 2022
Análisis Estadístico y Aprendizaje Automático para BioCiencias
Módulo 1: Lunes 24 de enero. Procesamiento de datos y Visualización.
- Estadística y Probabilidad: medidas de resumen y distribuciones de probabilidad.
- Introducción práctica a la programación en R.
- Manejo, pre-procesamiento, y exploración de datos tabulares.
- Práctico visualización: Generación de resultados científicos en R.
Módulo 2: Martes 25 de enero. Algunos Modelos Estadísticos
- Pruebas estadísticas paramétricas y no-paramétrica: valores p y sus críticas.
- Pruebas estadística bayesianas: Teoría de decisión y probabilidades a posteriori.
- Implementación y visualización de análisis estadísticos en R.
- Práctico transcriptómica: Análisis expresión génica diferencial y enriquecimiento funcional GO/KEGG a partir de conteos de ensayos RNA-seq.
Módulo 3: Miércoles 26 de enero. Aprendizaje Automático No Supervisado.
- Análisis de correlación y covarianza.
- Técnicas de reducción de la dimensionalidad: PCA, t-SNE, UMAP.
- Técnicas de clustering: Jerárquico, K-Mean, DBSCAN.
- Práctico Microbiomas: Exploración de muestras vía clustering y reducción dimensionalidad a partir de conteos del gen ribosomal 16S.
Módulo 4: Jueves 27 de enero. Aprendizaje Automático Supervisado I.
- Clasificación, Regresión, métricas de desempeño.
- Árboles de decisión; CART, Random Forest, XGBoost.
- Ajuste de hiperparámetros: búsqueda al azar, modelo bayesiano y algoritmos genéticos.
- Práctico metaboloma: Clasificación de enfermedades empleando datos metabolómicos.
Módulo 5: Viernes 28 de enero. Aprendizaje Automático Supervisado II.
- Neurona artificial y perceptron multi-capa.
- Algoritmos Backpropagation y Descenso estocástico del gradiente (SGD).
- Redes Neuronales Fully Connected, Convolucionales y Recurrentes.
- Práctico Deep Learning: Arquitectura y entrenamientos de Redes Neuronales Artificiales.
Horario, costo e información:
Vía Zoom. Lunes a Viernes 19:00-21:30. Santiago, Chile.
Inscripción: CL$25.000 vía transferencia bancaria o, USD$30 vía PayPal.
Inscripciones, dudas y más información: luis.valenz.v@gmail.com
Instructor:
Luis Valenzuela Villa, PhD en Biotecnología Molecular, Universidad de Chile
Fundador Omics Lab SpA. https://www.linkedin.com/in/luisvalenzuelavilla
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